Sicherlich ist die verstärkte Identifikation vieler Muslime mit "ihrer" Nation auch eine Folge des Krieges. Dies trifft aber genauso auch für viele Serben und Kroaten zu. Für die politische Führung um Izetbegovic gilt dies aber nicht. Ganz im Gegensatz zum Propagandabild der deutschen Medien, ist dieser nie für einen säkularen Staat eingetreten.

Nach dem Krieg wurde Izetbegovic von einem jugoslawischen Gericht wegen der Mitgliedschaft in einer pronazistischen Muslimorganisation verurteilt. 1970 gab er eine "Islamische Deklaration" heraus, für die er 1983 zu einer 11-jährigen Gefängnisstrafe verurteilt wurde. Darin wettert er gegen den Feminismus als Ausdruck einer "verdorbenen Schicht des weiblichen Geschlechts", die Juden, die kemalistischen Reformen in der Türkei und propagiert einen islamischen Staat. "Die erste und gewiß wichtigste Schlußfolgerung besteht in der Inkompatibilität des Islams mit nichtislamischen Systemen. Es gibt weder Frieden noch Koexistenz zwischen dem ‚islamischen Glauben‘ und nichtislamischen gesellschaftlichen politischen Strukturen." Den Anhängern der Zivilgesellschaft schreibt er ins Stammbuch: "Es gibt im Islam kein laizistisches Prinzip und der Staat muß Ausdruck der Religion sein und ihre moralische Konzeption untermauern."

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Izetbegovic unterhält zwar gute Beziehungen zur Türkei. Seine engsten Freunde sind dort aber nicht die kemalistischen Regierungsparteien, sondern Necmettin Erbakan und die Islamisten.

Lid geweest van van pronazistische moslimorganisatie, in 1970 al een islam-declaratie gepubliceerd,  waarvoor hij tot 11 jaar veroordeeld werd, met daarin het welbekende anti-semitisme en de rest…maar het hele westen stond dus achter de anti-semiet Izetbegovic.